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盖玻片的主要功能是保持固体样品平压，液体样品成形为均匀厚度的平坦层。 这是很必要的，因为高分辨率显微镜的焦点非常窄。

盖玻片通常还具有其他几个功能。 它将样品保持在适当位置（通过盖玻片的重量，或者在潮湿的安装的情况下，通过表面张力），并保护样品免受灰尘和意外接触。 它保护显微镜物镜接触样品，反之亦然；在油浸式显微镜或浸水显微镜中，盖滑动防止浸液和样品之间的接触。 盖玻片可以粘贴到滑块上，以密封样品，延缓试样的脱水和氧化。 微生物和细胞培养物可以在放置在载玻片上之前直接在盖玻片上生长，并且样品可以永久地安装在滑动件上而不是载玻片上。